علی بن ابراهیم دارای تألیفات فراوانی است از جمله:
1 - نوادر القرآن
2 - ناسخ و منسوخ
3 - قرب الإسناد
4 - الشرایع
5 - الحیض
6 - التوحید و الشرک
7 - فضائل أمیر المؤمنین علیهالسلام
8 - المغازی
9 - الأنبیاء
10 - المشذر
11 - المناقب
12 - اختیار القرآن